Thomas Lengauer war bis Mai 2018 Direktor und ist emeritiertes wissenschaftliches Mitglied am Max-Planck-Institut für Informatik in Saarbrücken sowie Honorarprofessor an der Universität des Saarlandes und der Universität Bonn.

Der Vorreiter im Bereich Bioinformatik hat u.a. über Analyse von molekularen Sequenzen und Strukturen geforscht und beschäftigt sich heute vor allem mit krankheitsorientierten Fragestellungen.

Seine Forschung wurde mit der Konrad-Zuse-Medaille der Gesellschaft für Informatik, dem Karl Heinz Beckurts-Preis und dem AIDS Forschungspreis der Heinz-Ansmann Stiftung gewürdigt. Er ist Mitglied des Präsidiums der Nationalen Akademie der Wissenschaften (Leopoldina) sowie Mitglied der Deutschen Akademie der Technikwissenschaften (acatech) und der Academia Europaea. Er ist Präsident der International Society for Computational Biology und Mitgründer der BioSolveIT GmbH, die Software zum computergestützten Wirkstoffentwurf entwickelt.